このページは 2007年 07月 15日 02時12分38秒 に更新した情報です。

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[ 135] 研究に有用なソフトウェア
[引用サイト]　 http://www.kenkyuu.net/computer-06.html

定番の文献管理ソフトです。特に、論文を書くときのReference作成の際に威力を発揮します。私自身論文を書くのに欠かせないソフトです。Mac版、Win版があり、最新版はver.9。 日本での購入はユサコ株式会社を通して購入します。新規購入は￥52,290、学生版は￥20,790です。アメリカでは、初回購入が￥299.95（オンラインダウンロードであれば、$239.95)、学生版が￥109.95、アップグレードは$99.95、オンラインダウンロードによるアップグレードなら$89.95です。中身は英語版そのものですが、残念ながら日本からはダウンロード版を購入できず、割高になってしまいます。 Endnoteを使用したソリューションについては「研究者のためのコンピュータ情報」＞「電子リソース、文献管理」をご覧下さい。 iPapersにはReferenceを書き出す機能はありません。インターネットでダウンロードした文献PDFファイルをiTunesによく似たインターフェースでデータベース化して整理することに特化したソフトです。一度使ったら手放せないソフトです。Mac OSX 専用のフリーソフトです。 PubMedをはじめとする数百を超えるオンラインデータベースから文献を読み込み、高速に動作する文献管理アプリケーションです。研究テーマにあわせたキーワードを登録しておくことにより、登録されているサイトを自動的に検索して、文献情報を逐次更新します。 私は使ったことがありませんが、Endnoteに近い機能を持ったソフトのようで、「文献管理データベース」と「参考文献リスト作成機能」を併せ持った論文作成支援ソフトウエアです。スウェーデン生まれのソフトですが、日本語化されています。Windowsのみです。 RefWorksは簡単に言うとEndnoteのオンライン版です。ユーザーが集めた文献情報は米国にあるRefWorksサーバー上に蓄積されます。そして、フォーマットしたいWordファイル（文献引用箇所には{{23}}という形でマーキングしておく）を指定すると、目的のJournalスタイルに合わせて引用文献が書き込まれたWordファイルをはき出してくれます。基本的にはEndnoteとワークフローは同じです。WEBベースの文献情報管理ツールってどういうしくみなんだろうと思っていましたが、当初予想していたよりよくできていました。個人契約だと年間13,000円。所属大学が契約していれば、無料で利用できます。 Endnoteと比較した場合、オンラインゆえ手順が多くなったり、変更が直ちに反映されなかったり、オンラインのレスポンスがいまいちだったりといった具合に、使いごこちにはEndnoteに軍配が上がります。したがって、私が今すぐEndnoteからRefWorksに乗り換えることはないのですが、RefWorksのいくつかのアドバンテージは見逃せないものです。一つは、WEBベースのアプリケーションで、ソフトも継続的にアップデートされているため、ソフトがうまく使えないということがないということ。Endnoteの場合、不具合が結構多く、特に、Wordがアップデートされると、急にEndnoteが使えなくなるということがこれまでにも何回も起こりましたが、こういった現象は基本的にはないという安心感があります。もう一つは、日本語が問題なく使えると言うことです。Endnoteも最新バージョンはユニコード化され日本語が使えるのですが、医中誌のデータは読み込めないなどの問題があります。しかし、RefWorksの場合、医中誌の読み込みも問題なく、PubMedと医中誌のデータが混在した引用文献リストも問題なく作れます。 PubMedからデータをファイリングしWordのテキストファイルに文献番号をつけて最後に一覧表示させる、というEndnoteで文献を論文につけることと、ほぼ同様なことができるようです。フリーウェアですし、様々な連携ソフトウェアがあります。（このソフトはBeignetさんからお知らせいただきました。ありがとうございました。）残念ながら、Bunsoの開発は中止されています。 残念ながら、2002年12月末で生産中止になってしまいました。統計解析の定番ソフト。特殊な解析でなければ、ほとんど対応できると思います。解説本もいろいろ発売されています。Mac版と、Windows版があり。日本語版の値段は10万円位します（高い！）。日本の代理店はヒューリンクス。 残念ながら、私は使ったことがありませんが、StatViewでできない解析もいろいろできるそうです。 「医薬研究者のための統計ソフトの選び方 」【bk1】【amazon.co.jp】を参考にして、現在よく使われている統計解析ソフトをまとめてみました。 ※使用論文数はBMJ, JCI, JPET, PNAS, JAPに掲載された論文のうち該当ソフトが使われている論文数。「医薬研究者のための統計ソフトの選び方 」による。 私も持っていますが、プレゼンテーションの方に力を入れているソフトで、グラフ作成ソフトとしては今ひとつ自由度が高くないという印象があります。自分好みのグラフを作るにはCricket Graphの方がいいと思います。また、グラフのシンボルにわざわざ専用フォントが必要になるのも好みが分かれるところです。日本の代理店はポラロイドがやっています。 非常に自由度の高いグラフ作成ソフトでしたが、残念ながら、生産中止になってしまいました。 残念ながら、私は使ったことがないのでコメントできません。Mac版と、Windows版があり。日本の代理店はヒューリンクス。 現在は、主にExcelについているグラフ作成機能を使ってグラフを作っていますが、自由度が低いので、満足なグラフが作れません。 私はまだ試していませんが、なかなかよさそうです。Hさんおすすめ。Kyplot裏技集や掲示板などがあり、サポートもいいようです。 私はこのソフトを使っています。比較的使いやすいと思います。値段は30万円位です。デモ版がwebサイトにありますので、試してみてください。 日本ではこのソフトを主に使っていました。以前は、Mac版とWindows版があったのですが、DNASIS ProとなってからはWindows版のみとなりました。Trial版が請求できます。 GCG Wisconsin Packageは上記のようなソフトのようにパソコンにインストールして使うソフトではなく、UNIXベースで使うソフトです。価格も年間100万円程度かかりますので、大学単位で購入することが多いです。ウィスコンシン配列解析パッケージは130以上のプログラムからなる配列解析用ソフトウェアであり、もともとはWisconsin大学で開発されたGCGソフトウェアから発展したものです。まさに総合遺伝子解析ソフトというべきもので、核酸・アミノ酸配列の解析、地図作成、配列比較、配列並置、RNAの二次構造予測、DNAフラグメント 分子生物学研究用遺伝子解析ソフト。塩基抽出、相補鎖への変換、アミノ酸への翻訳、制限酵素地図の作成、簡易ホモロジー検索、縮重記号を使った検索、塩基配列読み上げ、プライマーに適した配列の検索、プライマー配列の評価などが行えます。2000円のシェアウェア。 YASUさんおすすめの分子生物学研究用遺伝子解析ソフト。以下、推薦者のYASUさんのコメントです。 これまでに、ヨーロッパとアメリカ、あわせて6年間海外で研究生活を行ってきたのですが、いつも悩まされていたのが、Windows環境でのDNA、アミノ酸、シークエンスの解析ソフトでした。仕方なく、NEBCutterやEMBOSSなどのウェブサイトのサービスを利用して来ましたが、その面倒くささは、自分でも情けなくなるほどでした。先週、そのことを隣のラボのPIに愚痴っていたら、すごくいいプログラムを知っているから試してみたら、と言われて知ったのが、その恐るべきソフト、DNADynamoです。（www.bluetractorsoftware.co.uk/index.htmに行くと、無料のデモバージョンが手に入ります。）早速、デモモード（１MB程度のすごく軽いプログラム）を送ってもらって試してみたのですが、制限酵素マップ、アミノ酸配列、ORF、プライマーの表示など、とりあえず必要な機能はすべてOKでした。これまでに持っていたDNA Striderのfileがあけられるのはもちろんのこと、ABIのシークエンサーの生データまで開けられる上、いくつかのABIのシークエンスデータをalignしたり、というような、ちょっと高度な技もすべて完璧でした。自分はマニュアルに一度も目を通していないのですが、それでも、すべての技が簡単に実行できました。本当にお薦めです。Windows主流の研究所に入って、DNA解析ソフトがなくて泣いているポスドクは無数にいるので、是非紹介してみてあげてください。かなりの反響がくると思います。

　

[ 136] ＠IT：攻撃者に有用な情報を与えない対策法
[引用サイト]　 http://www.atmarkit.co.jp/fsecurity/rensai/iprotect02/iprotect01.html

他社および他組織のWebサイトなどへのポートスキャンおよびデータの取得などの行為で得た情報を侵入などに悪用するか、または同じ目的を持つ第三者に提供した時点で違法となります。ご注意ください。 本稿の内容を検証する場合は、必ず影響を及ぼさない限られた環境下で行って下さい。 また、本稿を利用した行為による問題に関しましては、筆者および株式会社アットマーク・アイティは一切責任を負いかねます。ご了承ください。 「第1回 攻撃者側から見た侵入前の事前調査（下見）」では、攻撃者が対象サーバに侵入を試みる際に、最初に行うだろう、ターゲットサーバの脆弱性の有無の調査方法を紹介した。今回は、攻撃者が利用できる情報をいかに与えないようにするかといった対策法を紹介する。 実行コマンドの先頭の %は一般ユーザー権限、#は管理者権限（root）によるコマンドの実行を意味する。 第1回で説明した事前調査は、サーバ内へ侵入するといったたぐいの攻撃ではない。そのため対策をしようがしまいが、事前調査によりサーバ内に侵入されてしまうことはまずない。 しかしながら、事前調査によって攻撃者に侵入するための有用な情報（OSやソフトウェアのバージョン情報など）を与えてしまうのは事実で、管理者からすれば、そういった情報をやすやすとは与えたくないだろう。 攻撃者に有用な情報を与えない対策として最初に挙げられるのが、バージョン情報を隠す（表示しない）方法だ。その方法を実現する手段としては、ソフトウェアの設定で行うことを推奨する。ソースコードを直接修正する対策は、運用を維持し続けることを考えるとあまり推奨できない。 Hat Linux 7.3上で説明する。OpenSSHについては、ソフトウェア設定による対策が現行バージョンでは行えない、さらにはソースコードのバージョン変更をすると正常に機能しなくなるため、今回は対象外とした。 なお、ここで説明する対策方法は、攻撃者に対してあくまで目くらましを行う程度のもので、攻撃者があれこれ考える人間であるからこそ有効な手段となり得る。そのため、現在も蔓延しているNimdaのように、ソフトウェアの種類に関係なく攻撃を行うものに対しては、まったくの無力であるということに十分注意してほしい。 telnetとWebブラウザを使用して、Apacheのバージョン情報が表示されなくなったことを確認する。 追加後、named.confを再読み込みするためnamedプロセスにHUPシグナルを送る必要がある。 本来ゾーン転送は、スレーブ（セカンダリ）のネームサーバに対してのみ許可するようにすればよいが、事前調査段階での設定ではすべてのホストからゾーン転送が可能となっていた。 helpfile（/etc/mail/helpfile）のバージョン情報を出力する個所（$v）を変更するかコメントアウト（先頭に#を付加）する。以下の例はsendmailに関する情報を表示しないようにする方法だ。 以上の設定が終了したら、telnetおよびエラーメールをもう一度送って、バージョン情報が表示されなくなったことを確認する。 これでバージョン情報が表示されなくなった。あるいはunknownとして表示されるようになった。 今回は、Apache、BIND、sendmailにおけるバージョン情報を与えないための設定などの対策方法を紹介した。次回は、今回得た情報を基に、対象サーバに対して実際の攻撃手法とその対策を紹介する。 トとして、不正アクセス監視やセキュリティ検査 などに従事している。金融機関、官公庁、大手製造業などへのセキュリティシ ステムの導入、セキュリティ 主に、不正アクセス監視サービス、セキュリティ検査、セキュリティポリシー策定支援などのサービス提供している。また、セキュリティに関する教育サー 攻撃検知のためのツールは数あれど、最終的にインシデントを判断するのは人間の目。実例からインシデントの特徴を見抜く力を養いましょう セキュリティ対策に完ぺきを求めなくてはならない「国家」のシステム。それを実現するためには、セキュリティを数学的に証明するモデルが必要でした URLをIDとして利用するOpenIDが注目を集めています。どのような仕組みであなたが「あなた」であることを証明するのかを確かめましょう 外部記憶メディアは情報漏えいの起点になる可能性があります。メディア運用のあるべき姿をケーススタディで考えてみましょう ホワイトペーパー利用者に「Amazonギフト券」を抽選で100名様にプレゼント！――TechTargetジャパン リニューアル・キャンペーン ＠ITトップ｜Security&Trustフォーラム トップ｜会議室｜利用規約｜プライバシーポリシー｜サイトマップ

　

[ 137] 問答有用
[引用サイト]　 http://otd2.jbbs.livedoor.jp/16618/bbs_index

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